04 November 2012

удивительная находка

Случайно открыл тетрадку, в которой вёл записи на семинарах по гуманитарным дисциплинам начиная со II курса. До конца обучения её вполне хватило. Но суть не в этом, а в том, что на полях этой тетрадки среди загадочных гуманоидов и прочих признаков скуки обнаружилось прекрасная перелицовка "Аптеки" Лаэртского:

Я работаю талибом,
Продаю взрывчатку всяку --
От пехоты и от танков,
Всяких сраных самолётов,
И ко мне приходят часто
Молодые моджахеды
И шахидки в чёрных платьях,
Чтоб взорваться поскорее,
Просят всяки динамиты,
Перекиси ацетону,
И пироксилина пачку
Я даю им вместо сдачи.
А надысь ввалилась шумно,
Блядь, чеченцев наглых стайка,
И достать просила слёзно
Гексогену, да побольше,
А не то, кричат, подохнет
Главный их, Шамиль Басаев,
Срочно требует, мол, бомбу,
Кремль взорвать, гад, дюже хочет.
Посылаю я их нахуй
С этой просьбой несуразной,
И они уходят тихо
И меня не беспокоят!

2005

27 April 2012

Как не надо заниматься компьютерной химией

Пока Владимир Игоревич ходит на представительные международные конференции, мы тут тоже времени зря не теряем и считаем чужие деньги. Сегодня мы считаем деньги МГУ, которые тратятся в том числе и на суперкомпьютеры, среди которых особое место занимает "Ломоносов". Но кто же и что на нём считает?

Считают на нём, например, эти замечательные люди. "Ускоряет и удешевляет", -- говорят они. Но говорят ли они правду? Как сообщила докладчица, для проведения вычислительного эксперимента "Ломоносов" был использован в монопольном режиме на майских праздниках в течение недели. Несложный расчёт с использованием прошлогодних тарифов (в этом году майские только ожидаются) подсказывает нам, что одной только электроэнергии было потрачено примерно на 1,3М рублей. 1,3 миллиона, да. Только на то, чтобы отобрать 40 структур (из 800 000; это 0.005%), потом протестировать (за отдельные деньги, естественно) и не найти ничего принципиально нового, только 14 малоактивных по отношению к конкретной мишени соединений. Нет, 14 из 40 -- это хороший результат, с ним можно работать дальше, но стоит ли он потраченных денег?

Не углубляясь в детали, можно сказать, что надо было применить более эффективный с вычислительной точки зрения метод. Скажем, вместо армии андроидов-копателей с позиционируемыми по GPS и ГЛОНАСС одновременно лопатами использовать для рытья котлована простой экскаватор, предварительно взорвав пару динамитных зарядов, чтобы часть удаляемой земли сразу взлетела на воздух (лучшие сравнения приветствуются). Тогда можно было бы не выгонять всех с мегакластера на неделю, а потратить два часа на десктопе на предварительный отбор и затем пару дней на более серьёзный анализ данных на небольшом кусочке мегакластера, скажем, на 32 узла из пяти с лишним тысяч. И получить точно такой же результат в сотню раз дешевле. А на оставшийся миллион (после накладных расходов, хе-хе) провести синтез, испытания in vitro и начать испытания in vivo (более точный расчёт ожидается). Но, как известно, у нас в деревне не ищут лёгких путей.